شناسایی و بررسی خصوصیات مولکولی ویروس موزائیک کدو (Squash mosaic virus) در استان‌های خراسان رضوی، جنوبی و مازندران

نوع مقاله : مقالات پژوهشی

نویسندگان

1 دانشگاه فردوسی مشهد

2 فردوسی مشهد

چکیده

ویروس موزائیک کدو (SqMV) یکی از مهم ترین ویروس‌های آلوده کننده گیاهان خانواده کدو در جهان می‌باشد. این ویروس متعلق به خانواده Sequviridae و جنس Comovirus بوده، ژنوم آن شامل دو قطعه RNA تک رشته‌ای مثبت می‌باشد. در طی ماه‌های فروردین تا مرداد ماه سال 1393، از گیاهان دارای علائم موزائیک، زردی و پیچیدگی سطح برگ در مزارع کدو، خربزه و هندوانه استان‌های خراسان رضوی، جنوبی و مازندران نمونه‌برداری صورت گرفت. آلودگی نمونه‌های مورد نظر توسط روش RT-PCR با استفاده از آغازگرهای اختصاصی مورد بررسی قرار گرفت، از میان176 نمونه گیاهی جمع‌آوری شده 10 نمونه آلوده به ویروس موزاییک کدو تشخیص داده شدند، نمونه‌های آلوده پس از همسانه‌سازی تعیین ترادف گردیدند. جهت تعیین جایگاه تکاملی این جدایه‌ها در مقایسه با سایر جدایه‌های موجود، درخت فیلوژنتیکی توسط نرم افزار MEGA6 رسم گردید. نتایج حاصله بیانگر آن بود که براساس مقایسه ترادف نوکلئوتیدی و آمینو اسیدی، جدایه‌های ایرانی در دو گروه جداگانه قرار می‌گیرند.

کلیدواژه‌ها


1- Avgelis A. D., and Katis N. 1989. Occurrence of Squash mosaic virus in melons in Greece. Plant Pathology, 38: 111-113.
2- Freitag J. H. 1956. Beetle transmission, host range, and properties of Squash mosaic virus. Phytopathology, 46:73-81.
3- Chinnadurai C., Ramkissoon A., Rajendran R., Tony S.T., Ramsubhag A., and Jayaraj J. 2015. First Report of Zucchini yellow mosaic virus and Squash mosaic virus Infecting Cucurbits in Trinidad. Plant Disease, 100 (4):866.
4- Goldbach R. W., and Wellink J. 1996. Comoviruses: molecular biology and replication. In The Plant viruses, vol. 5, Polyhedral Virions and Bipartite RNA Genomes, pp. 35±76. Edited by B. D. Harrison & A. F. Murant. New York: Plenum Press.
5- Gopo J. M., and Frist R. H. 1977. Location of the gene specifying the smaller protein of the cowpea mosaic virus capsid. Virology, 79:259-266.
6- Han S.S., Yoshida K., Karasev A.V., and Iwanami T. 2001. Nucleotide sequence of Japanese isolate of Squash mosaic virus. Archive of virology, 147 (2):437-443.
7- Haudenshield J.S., and Palukaitis P. 1998. Diversity among isolates of squash mosaic virus. Journal of Gen Virology, 79:2331–2341.
8- Hu J., Zhou T., Liu L., Peng B., Li H., Fan Z., and Gu Q. 2009. The genomic sequence of a Chinese isolate of Squash mosaic virus with novel 5' conserved ends. Virus Genes, 38 (3):475-477.
9- Kempo W. G., Wieda J., and Patrick Z. A. 1972. Squash mosaic virus in muskmelon and distributed commercially in Ontario. Canadian Plant Disease, 52:58-59.
10- Kendrick J. B. 1934. Cucurbit mosaic transmitted by muskmelon seed. Phytopathology. 24: 820-823.
11- Knuhtsen H.K., and Nelson M.R. 1968. Identification of two serotypes in squash mosaic virus. Phytopathology, 58:345–347.
12- Nelson M.R., and Knuhtsen H.K. 1973. Squash mosaic virus variability: review and serological comparisons of six biotypes. Phytopathology, 63:920–926.
13- Ling K.S., Wechter W.P., Walcott R.R., and Keinath A.P. 2011. Development of a Real-time RT-PCR Assay for Squash Mosaic Virus Useful for Broad Spectrum Detection of Various Serotypes and its Incorporation into a Multiplex Seed Health Assay. Journal of Phytopathology, 159 (10): 649-656.
14- Samiee A. 2004. Identification, distribution and some characteristics of viruses that infect greenhouse Iran. Master thesis. 158pp.
15- Shamshiri N. 2008. Biology and genome characterization features squash mosaic virus isolates in Iran. Master thesis. Shahid Bahonar University of Kerman.
16- Ullman D. E., Cho J. J., and German TL. 1991. Occurrence and distribution of viruses in Hawaiian Islands. Plant Diseases, 75:367-370.
17- Yoshida K., Goto T., Nemoto M., and Tsuchizaki T. 1980. Squash mosaic virus isolated frommelon (Cucumis melo L.) in Hokkaido. Ann Phytopath Soc. Japan, 46: 349–356.
CAPTCHA Image