TY - JOUR ID - 35249 TI - مقایسه فیلوژنتیکی جدایه ایرانی ویروس خراشک حلقوی میخک با جدایه‌های دنیا بر اساس ترادف ژن پروتئین پوششی و ژن پروتئین حرکتی JO - پژوهش های حفاظت گیاهان ایران JA - JPP LA - fa SN - 2980-8170 AU - آشنایی, مهناز AU - جعفرپور, بهروز AU - ملک زاده شفارودی, سعید AU - حیدری نیا, زینب AD - دانشگاه فردوسی مشهد AD - AD - فردوسی مشهد گروه بیوتکنولوژی AD - دانشگاه فردوسی مشهد-مشهد Y1 - 2015 PY - 2015 VL - 28 IS - 4 SP - 451 EP - 458 KW - ویروس خراشک حلقوی میخک KW - آنالیز فیلوژنتیکی KW - Dianthus caryophyllus DO - 10.22067/jpp.v28i4.45301 N2 - ویروس خراشک حلقوی میخک (Carnation etched ring virus, CERV)، عضو جنس Caulimovirus و خانوادة Caulimoviridae است. این ویروس به عنوان دومین ویروس میخک از نظر پراکنش در دنیا و تنها ویروس DNA دار گزارش شده از آن می‌باشد. بوته‌های آلوده به این ویروس از گلخانه چناران جمع‌آوری و با استفاده از جفت آغازگرهای اختصاصی طراحی شده برای نواحی حفاظت شده از ژن پروتئین ‌پوششی و ژن پروتئین‌حرکتی ویروس، به ترتیب قطعاتی در اندازه تقریبی1500 و 1000جفت ‌باز تکثیر گردید. این جدایه به همراه دو جدایه موجود از این ویروس (هند و هلند) و نیز تعدادی از دیگر ترادف‌های کائولیموویروس‌ها در بانک ژن مقایسه و پس از همردیف‌سازی چند‌گانه درخت فیلوژنتیکی آن‌ها برای ژن پروتئین‌ پوششی و ژن پروتئین‌حرکتی CERV با روش Neighbor joining و با استفاده از نرم افزار DNAMAN و MEGA5 ترسیم گردید. این آنالیز فیلوژنتیکی نشان داد که در مورد ژن پروتئین‌پوششی شباهت جدایه ایرانی در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی به ترتیب با جدایه هلند 9/98 و 3/99 درصد و با جدایه هند به ترتیب 3/98 و 6/98 درصد می‌باشد. هم‌چنین در مورد ژن پروتئین‌حرکتی شباهت جدایه ایرانی در سطح نوکلئوتیدی و آمینواسیدی با جدایه هلند به ترتیب 7/97 و 6/99 درصد و با جدایه هند به ترتیب 1/96 و 9/98 درصد نشان داده ‌شد. این اولین گزارش از مطالعات مولکولی درباره ویروس خراشک حلقوی میخک در ایران است. UR - https://jpp.um.ac.ir/article_35249.html L1 - https://jpp.um.ac.ir/article_35249_3228d109278c783326cb067060c14078.pdf ER -