%0 Journal Article %T نخستین بررسی ویروئید پوست پینه‏ای سیب در میزبان‌های سیب و گلابی در ایران و تعیین میزان تنوع ژنتیکی جدایه‏های ایرانی %J پژوهش های حفاظت گیاهان ایران %I دانشگاه فردوسی مشهد %Z 2980-8170 %A یازرلو, آرزو %A جعفرپور, بهروز %A کوهی حبیبی, مینا %A طریقی, سعید %A دبلیو رندلز, جان %D 2014 %\ 11/22/2014 %V 28 %N 3 %P 277-284 %! نخستین بررسی ویروئید پوست پینه‏ای سیب در میزبان‌های سیب و گلابی در ایران و تعیین میزان تنوع ژنتیکی جدایه‏های ایرانی %K ASSVd %K ساختار ثانویه %K همسانه‏سازی %K آنالیز فیلوژنتیکی %R 10.22067/jpp.v28i3.43538 %X ویروئید پوست پینه‏ای سیب، ASSVd(Apple scar skin viroid)، یکی از مخرب‌ترین بیماری‌های ویروئیدی در میان درختان میوه دانه‏دار بوده و میتواند خسارات اقتصادی چشم‌گیری ایجاد نماید. علایم این بیماری شامل شکاف خوردگی، بدشکلی و خال‌دار شدن میوه در باغات سیب و گلابی در استان خراسان رضوی مشاهده گردید. نمونه‌برداری از باغات سیب و گلابی صورت گرفته و RNA از برگ‌های درختان با استفاده از روش به دام اندازی سلیکا (Silica capture method) استخراج گردید. ASSVd پس از انجام آزمون RT-PCR در نمونه‌های حاصل از این باغات شناسایی شد. محصول PCR خالص گردیده و با استفاده از ناقلpGEM®-T Easy همسانه‏سازی شده و پلاسمید نوترکیب حاصل توالی یابی شد. پس از انجام آنالیزهای لازم، 12 جدایه جدید این ویروئید از میزبان‌های سیب و گلابی در بانک ژن (NCBI) ثبت گردید. این جدایه‏ها‏ طولی بین 334 -329 نوکلئوتید داشتند. آنالیز فیلوژنتیکی با استفاده از روش neighbor joining نشان داد که جدایه‏های ایرانی از سایر جدایه‏های این ویروئید مشخص بوده و در گروه جداگانه‏ای قرار گرفتند. تنوع ژنتیکی از طریق نشان دادن جایگاه‌های جهش جدایه‏های ایرانی بر روی ساختار ثانویه مولکول مرجع ASSVd مورد بررسی قرار گرفت. این مطالعه اولین گزارش از شناسایی و بررسی صفات ویروئید پوست پینه‏ای سیب در ایران میباشد. %U https://jpp.um.ac.ir/article_34776_602476545ed629b521ba9e719dc478a4.pdf